司马懿在三国志战略版中是一位顶级的智力型武将，其高达2.67的智力成长与98的基础智力奠定了其核心输出地位，同时优秀的统率成长也赋予了他不俗的生存能力，是一位能扛能打的后期法王。他的自带战法鹰视狼顾使其在战斗中能够积累奇谋与攻心属性，并在第五回合后开始造成可观的谋略伤害，这决定了以他为核心的阵容必须拥有强大的续航与减伤能力，将战斗拖入后期方能发挥其最大威力。围绕司马懿构建的队伍，核心思路便是前期稳守，后期制胜，通过坚实的防御体系为他创造安全的输出环境。
司马懿几乎有固定的最优解，即士别三日与用武通神的组合。士别三日能在前三回合提供规避效果并提升自身智力，极大增强了司马懿在前期的生存能力，平稳渡过其输出的真空期；而用武通神作为指挥战法，能够在第二、四、六、八回合对敌军两名武将造成稳定的谋略伤害，其伤害不受控制状态影响，且会回合推进不断提高，完美契合司马懿后期发力的特性。这套组合确保了司马懿在后期拥有毁天灭地的稳定输出，是其作为主将时最经典和强力的配置。
阵容构建方面，经典的司马盾（亦称太尉盾）是经过多个赛季检验的强力组合。最常见的阵容由司马懿、曹操和满宠（或郝昭）组成。在这个体系中，司马懿担任主输出手，携带士别三日和用武通神；曹操凭借其强大的辅助能力，通常携带锋矢阵来进一步放大司马懿的伤害，并携带藤甲兵或抚辑军民来为队伍提供极高的兵刃减伤；满宠则提供稳定的治疗和解除负面效果的能力，有时也由郝昭担任，提供不可被驱散的治疗与伤害。这套阵容利用曹操的增伤、队伍的高额减伤和回复，形成一个近乎完美的防御闭环，专门克制各类兵刃队伍，并能与大多数阵容一战。
司马懿通常选择虚实系列的兵书，例如攻其不备和将威，前者可以对已处于负面状态的敌军造成更多伤害，后者则能提升奇谋概率，让后期的爆发更加致命；再搭配占卜或神机等小兵书来提升稳定性。而辅助武将如曹操和满宠，则多选择九变或军形兵书，如临危不乱、援其必攻、励军等，以强化队伍的续航、解控和辅助能力。正确的兵书能如虎添翼，让整个体系的运作更加流畅。
使用司马懿阵容需要清晰的打法思路。由于队伍的核心输出集中在第五回合之后，因此要尽量避免与那些前三回合爆发极高的队伍硬碰硬，比如一些突击骑兵队。相反，应该主动去寻找与敌方中慢速队伍交战的机会，凭借铜墙铁壁般的防御消耗对手，等待司马懿的强势期来临一举收割。面对携带火攻的法师队时，如果使用了藤甲兵则需要格外谨慎，可以考虑将藤甲兵替换为暂避其锋等战法来应对。只要成功将战局拖入持久战，司马懿便能展现出其作为全三战最稳法师的恐怖统治力。
